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南极中山站沉积物宏基因组文库构建与碱性蛋白酶基因ACPRO001克隆、表达和性质

收藏本文 2024-03-18 点赞:17311 浏览:65085 作者:网友投稿原创标记本站原创

摘要:从南极中山站排污入海口(ZSS)沉积物样品中提取环境样品微生物总DNA,大小在48Kb以上。经过吹打调整DN段大小(到30-45Kb)后构建了ZS coid宏基因组文库,了约6500个阳性克隆子。推算该DNA文库的总容量为228Mb,可以覆盖约10株类似E.cop菌株的总基因组。蛋白酶活性筛选功能板筛选该文库了一个编号为1146的阳性克隆分解底物脱脂牛奶,在筛选平板上产生清晰的透明水解圈。DNA测序后分析该克隆外源DNA包含一个由425个氨基酸编码组成的蛋白质的完整的开放阅读框(ORF),GC含量为50.6%。BLAST软件分析该外源DNA包含一个完整的碱性蛋白酶基因,预测该蛋白质的分子量Mw为44.833kD。PCR扩增了蛋白酶基因的DNA序列并连接到大肠杆菌表达载体pET-His上,在大肠杆菌BL21(DE3)中实现了表达,并对该酶的生化特性了研究。酶学数据克隆1146所产碱性蛋白酶最适作用pH值为9.0,最适温度为60℃。在50℃条件下具有较好的耐热性。将该DN段所编码的基因命名为ACPRO001基因,将该DNA序列在Genbank数据库中登记,登记号为FM163400。为在活力,以及热稳定性、pH值等发生正向突变的突变株,用易错滚环复制方法对该蛋白酶的定向进化了初步的研究,了800个克隆,但并发生正向突变的克隆,该工作还在当中。关键词:宏基因组论文碱性蛋白酶论文定向进化论文

    摘要8-9

    ABSTRACT9-10

    1.前言10-18

    1.1 极端生物10

    1.2 嗜热微生物和高温酶10-11

    1.3 未培养技术11-12

    1.3.1 未培养微生物资源介绍11

    1.3.2 纯培养技术与未培养技术11-12

    1.3.3 环境宏基因组学12

    1.4 碱性蛋白酶介绍12-13

    1.4.1 碱性蛋白酶的背景和现状12-13

    1.4.2 碱性蛋白酶作用机制机理介绍13

    1.5 酶的定向进化介绍13-14

    1.5.1 酶的定向进化介绍13-14

    1.5.2 易错滚环复制技术介绍14

    1.6 南极、深海生态学研究简介14-18

    1.6.1 南极概况14-15

    1.6.2 深海环境简介15-16

    1.6.3 南极微生物学研究进展16-18

    2.与方法18-35

    2.1 18-24

    2.2 基本方法24-27

    2.3 ZS位点土壤沉积物样品微生物宏基因组Coid文库的构建及研究27-32

    2.4 ZS coid DNA宏基因组文库中蛋白酶酶活筛选32

    2.5 Fopn-酚法测定蛋白酶活力32-33

    2.6 蛋白酶的定向进化-易错滚环扩展法33-35

    3.结果与分析35-49

    3.1 南极中山站排污口土样微生物宏基因组文库的构建和研究35-39

    3.1.1 土壤样品中大片段DNA提取结果35

    3.1.2 土壤样品中大片段目的DNA的分离筛选35-36

    3.1.3 土壤样品中大片段目的DNA的回收和浓度控制36-37

    3.1.4 土壤样品中大片段目的插入DNA末端补平和浓度控制37

    3.1.5 ZS Coid宏基因组文库构建和评估37-39

    3.2 ZS Coid宏基因组文库的蛋白酶活性基因的筛选39

    3.3 蛋白酶基因的克隆和测序39

    3.4 蛋白酶基因的序列分析39-43

    3.5 蛋白酶基因在大肠杆菌中的表达及产物纯化43-44

    3.6 蛋白酶性质44-47

    3.6.1 温度对酶活力及稳定性的影响44-45

    3.6.2 pH值对酶活力的影响45

    3.6.3 钙离子对酶热稳定性的影响45-46

    3.6.4 金属离子及螯合剂对蛋白酶活力的影响46-47

    3.6.5 表面活性剂对蛋白酶活力的影响47

    3.7 蛋白酶的定向进化改造47-49

    4.讨论49-52

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